生物堿是天然中藥材中分量很重的一類活性成分，多具有顯著而特殊的生理活性，在消炎、鎮痛、降血壓、抗癌等發面表現出越來越重要的藥用價值。傳統生物堿的分離方法主要有：浸漬、煎煮、溶劑回流、滲漉等，以及新開發的超臨界流體萃取技術，微波輔助提取技術，超聲輔助提取技術，雙水相萃取技術等。上海樊克生物有限公司對生物堿這一類物質的分離利用常規方法，總結了一些分離技巧，獲得生物堿分離純化的的方法，不但可以提高產品純度，也可以提高收率。


以去甲異波爾定這個生物堿為例，去甲異波爾定屬于異喹啉生物堿，按照常規的分離生物堿的方法是，先對藥材進行提取、濃縮，再利用乙酸乙酯或者二氯甲烷進行萃取，然后通過硅膠柱柱層析分離，收集到產品的主產品段，再進行二次硅膠柱純化或者結晶得到純品；但是去甲異波爾定的提取原藥材是烏藥，提取濃縮液比較粘稠，而且顏色也很深，直接進行萃取，一方面是乳化嚴重，另一方面耗費的有機試劑也比較多，大大增加了成本。

通過大量的研發實驗，總結了一些技巧，技巧一：采用大孔樹脂的富集，同時進行酸堿的合理調整，靈活運用生物堿游離態和鹽酸鹽形式的轉化，使生物堿的分離過程降低了成本，簡化了生產步驟，同步，生物堿純度的上升也得到的很好地提高；技巧二：靈活合理地利用結晶方法，具體地說是結晶與硅膠柱巧妙結合，通過硅膠柱改善產品半成品的顏色和粘度，然后利用結晶技巧完成產品純度的上升，結晶試劑的合理選擇以及結晶參數的嚴格控制是很關鍵的。成都瑞芬思生物科技有限公司利用常規方法，常規試劑但是通過生物堿分離純化的技巧實現了生物堿類成分地分離純化，成本低，收率提高了 30% 左右，積累了生物堿不同類別的分離純化工藝。


此外，在畢扣扣靈堿，又名(+)-荷包牡丹堿，以及吐根中的生物堿成分如鹽酸吐根堿、鹽酸吐根酚堿，Ipecoside 等生物堿的提取分離方面也取得了良好的效果，產品純度均可達到 99% 以上