一、載體與質粒的區別

1.載體（Vector）的概念
把一個目的基因通過基因工程手段送到生物細胞（受體細胞），需要運載工具（交通工具）攜帶外源基因進入受體細胞，這種運載工具就叫做載體（vector）。
基因工程上所用的載體是一類能自我復制的DNA分子，其中的一段DNA被切除而不影響其復制，可用以置換或插入外源(目的) DNA而將目的DNA帶入宿主細胞。常用的載體有質粒、噬菌體、病毒等。

載體的功能及特征：
運送外源基因高效轉入受體細胞
為外源基因提供復制能力或整合能力
為外源基因的擴增或表達提供必要的條件

載體應具備的條件：
具有針對受體細胞的親緣性或親和性（可轉移性）
具有與特定受體細胞相適應的復制位點或整合位點
具有較高的外源DNA的載裝能力
具有多具有合適的篩選標記

種單一的核酸內切酶識別切割位點

2.質粒（Plasmid）的概念
質粒是生物細胞內固有的、能獨-立于寄主染色體而自主復制、并被穩定遺傳的一類核酸分子。質粒常見于原核細菌和真菌中，絕大多數的質粒是DNA型的，少部分為RNA型。天然DNA質粒大都具有共價、封閉、環狀的分子結構，其分子量范圍：1-300 kb。細菌質粒是基因工程中蕞常用的載體。

質粒的基本特征：
質粒的自主復制性：質粒能利用寄主細胞的DNA復制系統進行自主復制，其DNA上的復制子結構決定了質粒與寄主的對應關系，并根據在每個細胞中的分子數（拷貝數）多寡，質粒可分為兩大復制類型：

嚴緊型復制控制的質粒 1 - 3 拷貝
松弛型復制控制的質粒 10 - 60 拷貝
質粒的不相容性：任何兩種含有相似復制子結構的不同質粒，不能同時存在于一個細胞中，這種現象稱為質粒的不相容性，不相容性的質粒組成不相容性群。以大腸桿菌的質粒為例：
ColE1、pMB1 擁有相似的復制子結構，彼此不相容。
pSC101、F、RP4 擁有相似的復制子結構，彼此不相容。
p15A及其衍生質粒擁有相似的復制子結構，彼此不相容。

質粒的可轉移性：革蘭氏陰性菌的質粒可分成兩大類：
接合型質粒——能在天然條件下自發地從一個細胞轉移到另一個細胞（接合作用），如F、Col、R質粒等。
非接合型質粒——不能在天然條件下獨-立地發生接合作用如Col、R的其它成員。值得注意的是，某些非接合型質粒（ColE1）在接合型質粒的存在和協助下，也能發生DNA轉移，這個過程由 bom 和mob 基因決定攜帶特殊的遺傳標記：野生型的質粒DNA上往往攜帶一個或多個遺傳標記基因，這使得寄主生物產生正常生長非必需的附加性狀，包括：

物質抗性：抗生素、重金屬離子、毒性陰離子、有機物等。
物質合成：抗生素、細菌毒素、有機堿等。
這些標記基因對DNA重組分子的篩選具有重要意義。


二、質粒載體的分類
天然存在的野生型質粒由于分子量大、拷貝數低、單一酶切位點少、遺傳標記不理想等缺陷，不能滿足克隆載體的要求，因此往往需要以多種野生型質粒為基礎進行人工構建。
質粒載體按功能分：

克隆載體—都有一個松弛的復制子，能帶動外源基因，在宿主細胞中復制擴增。它是用來克隆和擴增DNA片段（基因）的載體。
表達載體—具有克隆載體的基本元件（ori,Ampr,Mcs等）還具有轉錄/翻譯所必需的DNA順序的載體。

質粒載體按進入受體細胞類型分：
原核載體
真核載體
穿梭載體（sbuttle vector）指在兩種宿主生物體內復制的載體分子，因而可以運載目的基因（穿梭往返兩種生物之間）。穿梭質粒含原核和真核生物2個復制子，以確保兩類細胞中都能擴增。

質粒載體按功能分：
高拷貝質粒：突變拷貝數控制基因 拷貝數1000-3000擴增基因
低拷貝質粒：來自pSC101 拷貝數小于10 表達某些毒性基因
溫敏質粒：在不同溫度下表現出拷貝數、整合等不同性質
測序質粒：含有測序通用引物互補序列和多酶接頭polylinker
整合質粒：裝有整合促進基因及位點 便于外源基因的整合
探針質粒：裝有報告基因 便于啟動子等元件的克隆