同位素標記 (同位素內標)較于其同種元素的未標物具有質子數相同中子數變化的特點，通過用同位素取代特定原子來標記反應物，然后使反應物進行反應，并檢測中子數變化的原子，可通過反應、代謝途徑或細胞跟蹤同位素。

同位素內標物與對應的未標物理化性質相似，通過光吸收和免疫的方法無法區分，在色譜中如果將同位素內標物與對應的未標物用同樣的檢測方法，其保留時間也幾乎一致，無法分辨。

穩定性同位素內標是質譜方法即穩定性同位素稀釋法du有的，在質譜(Mass)中，如果加進同位素內標，那測出來的值較未標物有很大的差值，質譜能把同位素內標和要檢測的物質區分開。

可供多種穩定同位素標記的內標，包括2H (氘標 D) 、13C、15N、17O、18O、34S等，放射性的同位素內標具有較大的傷害性，一般穩定性同位素可以完成的建議優-選穩定性同位素內標物，若被檢測物是穩定同位素內標物對應的未標物，那么，較被檢測物而言，對應的同位素標記物只是將部分氫原子(1H)、碳原子(12C)或氮原子(14N)等被2H (氘、D)、13C、15N所取代，被檢測物與對應的穩定同位素內標物理化性質基本一致，尤其在色譜中，幾乎無法區分。

同樣是穩定同位素標記，13C、15N相對來說比2H(氘標) 好，所以氘標(D、2H)一般也相對而言便宜，色譜定量中，2H、13C、15N標記的差別不大，如果需要質譜(MS)或者核磁(NMR)定量，一般建議優-選13C或者15N標記。

目前同位素內標廣泛應用于檢測中：包括維生素檢測、膽汁酸檢測、激素檢測、兒茶酚胺檢測等